A Missão da Indústria Farmacêutica é fomentar a inovação e o desenvolvimento de terapêuticas que respondam às necessidades de tratamento e prevenção de novas patologias, bem como disponibilizar medicamentos que constituam uma melhoria para a saúde e qualidade de vida das populações.

Ao levar a cabo a sua missão, a Indústria Farmacêutica defende elevados padrões éticos e de qualidade, a que se aliam a responsabilidade social e o dever de solidariedade.

O objectivo primordial da Apifarma é defender os interesses comuns dos seus associados, nomeadamente:

• Defesa de elevados padrões de qualidade, segurança e eficácia dos medicamentos produzidos;
• Defesa de um sistema de aprovação dos medicamentos célere e eficiente;
• Protecção dos direitos de propriedade industrial;
• Proximidade com o Doente, primeiro destinatário da sua actividade;
• Interacção com a comunidade científica, quer pela permuta do conhecimento, quer pela preservação do património científico;
• Promoção de uma cultura de defesa ambiental, como salvaguarda da Saúde Pública;
• Proximidade com a Comunidade, para divulgação da sua missão e valores.